关卡模式可以说是元气骑士中最重要的模式，在完成关卡模式的战斗后，就会解锁新的区域，让角色可以在新区域中参与到战斗当中去。在开始的关卡模式一共有五个大关，每个大关中又有五个小关在，也就是一共有二十五个关卡，将所有关卡完成后，就能顺利完成所有关卡，达到进入下一个场景的要求，在整个关卡模式中难度最高就是最后要面对的打boss。
来到关卡模式后，要想顺利通关所有关卡，选择的角色骑士并不是主要因素，虽然职业不同，但是每个角色都拥有独特的技能，也就是每个角色都不算弱。最重要的因素就是技术，只要技术到家顺利来到最后一关还是很简单的。在前面所有关卡中，只需要关注血量和武器。
血量可以说是能顺利完成通关的关键，只要在boss战斗中尽量不出现血量耗尽的情况下，就能保证自己一直通往下一关。而武器决定了一个角色输出的上限，强大的武器能大大降低通关难度，相同的boss伤害高的武器通关时间肯定比武器差的角色通关时间短。
关卡中血量在消耗后，可以在商店中购买血瓶回复，还可以在能力中选择吸血，这样就能通过攻击不断回复自身血量。一些治疗的法师，技能就能恢复自身血量，所以要让血量保持在健康状态有很多种方式。至于武器就更简单了，在每个关卡都有武器可以让玩家挑选，选择品质高的紫色红色武器，对对于通关的帮助肯定是更加明显的。
