宝石系统分为宝石还有晶石和神石这三个大阶段，每个阶段都是从一级开始的，并且每个都有着不同的最高等级。在八十八级第二次打败了曹操之后研究完成相应的宝石科技就能开启宝石的玩法了，首先开放的是宝石系统，一共有十五级。同时还会开放宝石商人，宝石的主要用途就是镶嵌在兵器上，这需要先在兵器上开启能镶嵌宝石的孔洞。宝石商人则是用镔铁交换宝石的途径，但从宝石商人这里换来的宝石数量会比较少。
在宝石到达了十五级之后进行打磨就可以变成晶石，晶石就一共有四十个等级了，最初的晶石只能打磨六颗，只有凑齐了六颗神石之后才能够打磨更多的晶石。晶石可以通过吞吃宝石进行升级，在晶石升级到十五级之可以激活四个技能，用精炼将四个技能洗成同样的技能后就可以在晶石二十一级的时候升级成为技能石。当晶石变成了技能石价格就能直接翻倍，而且技能会随着技能石等级的提高而升级，六个技能石会开启搜刮功能，在武将占领城池之后没点火的情况下可以获取一定的资源。
技能石达到二十级且右侧技能是相同技能后使用进化卷轴就可以升级成为神石，集齐六颗神石之后便可以获得屠城技能。可以开始摧毁城墙从而占领这座城池，屠城这个功能对于国战来说是非常重要的，只要发动屠城就表示拿下对手城池。神石是可以继续升级的，只要两次打过一百九十一级的副本就能开放神石升级，有了神石之后战斗力跟前面几种宝石完全不同，但神石的条件还是非常的难升的。
神石可以通过吞吃晶石来进行升级，最高等级是十级，开发完神石强化科技以后这时候打磨晶石就不需要花金币了。在全部六颗神石都到了十几级之后可以选择全地形屠城，全地形屠城分为三种，只可以选择其中一种地形就是平原、水域和山地的一种。全地形屠城以后不仅可以换屠特殊地形，正常的城市甚至都可以屠城了。但需要注意屠野城和正常屠城的次数是共享的，如果像保留屠野城次数就要合理分配了，另外屠野城是不可以合力的，因此回复的时间也比较快所以使用的时候也要多留个心眼子。
